关于肇事司机掉包的情况，保险公司在某些情况下有权拒赔。这些情况包括但不限于事故是投保人故意制造的，或者因被保险人的挑衅、故意行为导致的打斗等。此外，如果被保险人自伤或自杀（除非自杀时为无民事行为能力状态），也可能导致保险公司拒赔。根据《保险法》的规定，如果投保人故意隐瞒事实或提供虚假信息，同样可能导致保险拒赔，给事故处理带来不便，甚至可能引发法律责任。
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针对肇事司机掉包导致的保险拒赔问题，常见的处理方式包括协商、起诉以及申请保险垫付。具体选择哪种方式，应根据肇事方的态度和实际情况来定。如果肇事方愿意承担责任，双方可以协商解决；如果协商无果，可以考虑起诉；同时，也可以向保险公司要求先行垫付。